數十年以來，無國界醫生一直積極參與參與 人道救援工作，除了應對天災之外，亦有長期的醫療項目。當世界上某個國家或者地區出現災情時，無國界醫生會迅速申請 人道工作，透過預先準備好的救災套裝，數小時內即可開展行動，為災民提供救援。
為更好配合以及參與 人道救援工作，無國界醫生組織在全球各地設置有物資供應中心以及倉庫，有專人負責採購、測試以及儲存設備，包括越野四驅車、通訊設備、電力供應、食水處理設施以及營養補充品。在24小時內裝載物資並且空運到災區。
當某個地區發生災難後，後續的醫療護理工作將會相當繁重，當地政府可能需要面對爆發的公共衛生問題。無國界醫生組織會參與 人道救援工作，協助災區人們獲得醫療護理服務，並且盡力處理日常醫療護理以及長期病患。
參與 人道救援工作不僅僅是物資、醫療，組織的創辦人有醫生，同時亦有記者，透過揭露真相終止暴行。無國界醫生組織更提倡藥物公平分配，為患者爭取目前欠缺的治療，同時會收集數據，致力於改善醫療項目以及救援行動。